为了进一步改善民生，提高政府的效率，警惕地方势力的发展壮大，刘秀于建武六年（公元30年）下诏令司隶州牧各实所部，省减吏员，县国不足置长吏可合并者，上大司徒、大司空二府。经过一番革旧翻新，地方官吏缩减至十分之一。
在取得政府改革的成功的同时，光武帝刘秀还双管齐下，下诏废除西汉时的地方兵制，撤销内地各郡的地方兵，裁撤郡都尉之职。除此之外，刘秀还取消了都试，即郡内每年征兵训练时的测试。地方的防务则改由招募而来的专门的军队担任。自此，刘秀相信，天下只要按他描绘的蓝图和既定的国策继续下去，刘氏一族定然能够千秋万世、一统天下。
可惜，理想很丰满，现实很骨感。
坐拥江山
刘秀在建国后，复立五经博士，恢复太学。太学学生都将入朝为官作为了学习的最高目标，由此，才能够光耀门楣、光宗耀祖。
在治国思想上，刘秀依然延续了西汉武帝的思想，十分崇尚儒术的力量。一次，光武帝刘秀在巡幸鲁地之时，曾派大司空率领百官前去祭祀孔子，后来还将孔子后裔孔志封为褒成侯，他的意图天下皆知，旨在彰显自己尊孔崇儒，要求天下人学习自己，大力学习儒家学说。
孔子更是把“仁”作为最高的道德标准、道德原则和道德境界，而孝悌是仁的基础。所以东汉才会特别重视“举孝廉”的选官制度，自然，儒家思想提倡的这些，对于当时而言，无论是实现统治还是接受统治的人，都是有很大的积极作用的。然而美中不足的是，刘秀竟然对当时儒家的谶纬迷信之说崇拜备至。这使得后来在皇宫内部，产生了一连串的宫闱悲剧。
光武帝对内大刀阔斧、不拘一格地进行改革，对外则施行铸剑为犁、止戈息武的策略，有人不禁想到，难道北方匈奴政权也承认刘秀真命天子的地位？何以他们会一直甘于寂寞呢？
其实，前文已经提到，早在王莽新朝之时，王莽就准备率领大军北击匈奴，只可惜后来因为中原大乱，王莽北伐之事只能不了了之。然而此刻的匈奴，却依然没有任何动作，没有南下入侵中原？这又是为何呢？
实际上，匈奴单于利用了这次中原内战的机会，只是他没有将触手伸到中原内地，而是在新建始国二年（公元10年）夺取了对吐鲁番国的保护权，此后还不时袭击中原边境。
到了王莽政权覆灭，天下大乱之时，匈奴却是天灾人祸不断，抽不出身子，好不容易重新归于统一的匈奴，因此而失去了在中原横行的机会。
历史记载，自建武十六年（公元40年）之后，匈奴汗国一连几年大旱，赤地千里，寸草不生，牛羊战马饿死者，足足百万之众。内忧之下，外患也接连不断，并对匈奴政权造成了很大的打击。如当时东方新兴的强敌乌桓部落，眼看匈奴衰微，自然不会放过这个凌辱昔日一直欺负自己的对手的机会，遂向东方不断侵袭。匈奴大军在数次大战均告失败的情况下，只能在单于的带领下，不断后撤。其势力范围从原来的整个蒙古草原，萎缩至蒙古哈尔和林及以南地区，大批人畜因战乱和灾荒而死亡，国力大衰，以致各部分立，呈一盘散沙之态。
建武中元二年（公元57年）二月戊戌日，刘秀在南宫前殿逝世，享年六十二岁。
后世之人，对于光武帝刘秀亦有各自不同的评价，其中王夫之说道：“光武之得天下，较高帝（指西汉高帝刘邦）而尤难矣！自三代（指夏、商、周三代）而下，唯光武允冠百王矣。”司马光亦说道：“自三代既亡，风化之美，未有若东汉之盛者也。”
近世梁启超还说：“东汉尚气节，崇廉耻，风俗称最美，为儒学最盛时代。”此外，还有曹植、诸葛亮等人，对于光武帝刘秀都有自己的论述，虽然言语不一，观点亦有出入，但是总的基调都大致相似，对于光武帝刘秀的一生功业，都持肯定之声。
当然，也有人对其过错做出过总结，认为他是一个固执和迷信的人，特别是在对巫蛊之事上，更加地显露无遗。此外，他还经常对批评作出过分的反应，以至于那些劝谏之人，随时都有被斩杀的危险。刘秀还是一个缺乏预见他行动后果的眼光的人，对于公孙述以及后来的匈奴，都没能够兵不血刃地获取胜利，反而付出了沉重的代价，可见其在外交上还略有不足。
光武帝刘秀跌宕起伏、波澜壮阔的一生就此宣告结束，半世戎马、辛苦经营打下来的万里江山，于辗转之间，传到了刘庄的手中，延续着刘家的天下。刘秀一生，短短六十余年光景，却让后世之人不断缅怀和赞叹，他留给后世的，是数百年大汉的功业？还是一个个发人深省的启示？
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