在其他人紧锣密鼓的组装电路连接阳电子炮的时候，铭烟薇已经驾驶着零号机从专门清理出的通道往头顶使徒所在的方向前进了，而或许是这使徒正忙着钻洞，一直到铭烟薇来到地面他才发现铭烟薇。
第五使徒在发现零号机的那一瞬间就发动了攻击，不过铭烟薇可不是碇真嗣，她可不会站在原地承受使徒的攻击，在使徒的光束发出的前一刻，铭烟薇便控制着初号机就地一滚翻滚，不但躲开了攻击，而且还更往前了一段距离。
在翻滚的过程中，铭烟薇将零号机的AT立场功率调到最大，直接将他笼罩在周围防御的AT立场瓦解，当铭烟薇控制着零号机起身的时候，零号机背后的四十米巨剑已经握在手中。
AT立场已经瓦解，现在她距离第五使徒又只有一个多身位的距离，再加上这第五使徒伸出的钻头已经深入道第三冬京市的地下，所以他连躲避都无法躲避。
如此近的距离，别说是铭烟薇了，换成其他人也是这样，就算比这眼睛都能砍中，于是跟上一次极度相似的一幕再次出现了，没有了AT立场保护的第五使徒直接被铭烟薇一剑连同核心切成了两半，将他已经积蓄了一半的攻击也一同打断。
将第五使徒切开之后，铭烟薇没有停留，直接往后一跳，毫不犹豫的钻回了通道当中，而在铭烟薇驾驶着零号机回到通道的那一瞬间，第五使徒发出了巨大的叫声，紧接着核心突然变成了红色的液体炸开，最后整个菱形的巨大身躯完全变成了红色的液体。
指挥中心的人看到这一幕，全部都惊呆了，他们没想到铭烟薇如此出色的完成了任务，干脆利落的解决了第五使徒，不过这终究是好事。
解决了第五使徒的铭烟薇回来之后得到了众人的称赞，其他人看向叶云的目光当中也充满了钦佩，然后…然后叶云就被葛城美里叫到她的办公室去了。
葛城美里带着叶云一进到办公室便直接开口说道：“叶云，我知道你的实力跟能力都不错，但这是事关整个世界安危的事情，稍有不慎就有可能导致整个世界都毁于一旦，我们不能太过于冒险，所以我希望你能理解我。”
叶云点了点头，道：“我懂，不过我相信自己的判断，以后要是再出现这种情况，我依然会站出来，我们不能将希望全部寄托在一个人的身上，不过我会先跟指挥官你先商量一下。”
葛城美里听到叶云这回答，满意的点了点头，示意叶云可以离开了，待叶云离开之后，葛城美里看着已经关闭的房门，露出了若有所思之色，低声呢喃道：“不能将全部的希望寄托在一个人身上吗？或许你是对的。”
叶云并不知道葛城美里因为他的话，心中的想法已经悄然发生了改变，她不在将所有的希望都放在碇真嗣的身上，不过她将希望放在谁的身上其实并没有区别，因为这个世界注定不会再按照原来的轨迹走了。
之后的今天虽然因为叶云跟铭烟薇的插手，让剧情发生了改变，碇真嗣没有像原剧那样，在打完第四使徒之后就离开了，他依然还在接受叶云的训练，包括绫波丽也是。
绫波丽因为铭烟薇暂时顶替了她的位置，所以不需要上场，现在他身上的伤势已经完全恢复了，所以现在除了上学之外，也跟碇真嗣一起接受叶云的训练。
这样的日子持续了十来天，终于发生了改变，明日香跟二号机即将抵达岛国，他们要前去交接，而随同护送舰队一起过来的，还有加持，也就是葛城美里的前男友。
他的这个身份并不是叶云所关注的，叶云关注他是因为他这次回来还带了一样东西，一样人类补全计划当中非常重要的东西，亚当的肉体。
原本亚当二笔发现的时候是一个长着巨大光翼的百米巨人，第一次冲击就是因为亚当被发现而引起的，当时也不知道死了多少人跟动物。
第一次冲击之后，人类将亚当“回收”，并让亚当退化，从百米高的巨人变成了一个只用手提箱就能装走的胚胎，而加持将亚当带来是因为，碇真嗣的父亲碇源渡想要将亚当移植到自己的身上。
他之所以这样做是因为他的妻子在一次驾驶初号机的时候消失在了驾驶舱，不过这个消失并不是说她死了，而是她的身体消融，灵魂进入到了初号机的核心当中，而当初号机获得生命之果时，就是她获得永恒生命的成神时刻。
碇源渡将亚当移植到自己的身上其实也是打着同样的想法，因为他唯一的愿望就是再次见自己的妻子，但自己的妻子已经成神，所以想要再见她，自己就必须成神，而亚当就是他成神的机会。
当然单纯将亚当移植到自己的身体内是无法成神的，因为这个亚当只是一个躯壳而以，不过他已经找到了亚当的灵魂，而亚当的灵魂正是第十七使徒，渚薰。
如果让渚薰在一个合适的时机死去，那他的灵魂就回回到亚当的躯壳之中，而当亚当的灵魂与躯壳融合为一的时候，就是碇源渡成神的时候。
原剧中碇源渡有没有成功叶云没有看懂，不过他确实再次看到了自己的妻子，而叶云关注加持并不是像抢亚当，他其实只是像弄点样本而以。
碇源渡并不知道叶云已经盯上了他志在必得的亚当，不过他虽然没有发现，但却出于谨慎，为了让计划不出纰漏，也为了避免计划进一步出现不可预料的变化，他没有让铭烟薇参与二号机以及专门运来给她驾驶的二号机?改的交接工作，而是以加强训练的名义跟叶云一起被留了下来。
他这样做的目的是因为明日香是EVA驾驶员当中唯一跟碇真嗣同龄的女孩，而人类补完计划成功之后需要新的亚当跟莉莉丝，现在亚当已经确定为碇真嗣，所以明日香的身份就可想而知了。
然而，这一切真的会如碇源渡所预料的那般吗？
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