故事的主体是一个生存游戏，是一个未来日记持有者们相互残杀的故事，这种情况下，相互算计，时而合作，时而背叛，是再正常不过的事情。
不过，哪怕男主的实力一直都很弱，女主也从来没有放弃过男主，对男主各种帮助，各种拯救。
虽然女主病娇的性格，让男主有点受不了，但经历了一些事情之后，他还是决定相信女主，直到他无意中发现了关于女主的最大的一个秘密。
原来，男主所经历的一切，对女主来说却是二周目的事情。
一周目，男主和女主干掉了其他所有的未来日记持有者，但马上就是末日。
两人相约殉情，可最后男主倒是死了，女主却偷偷活了下来，成为掌控时空的神，然后逆转时空，来到二周目的世界，将二周目的自己一斧头砍死，接着伪装成二周目的自己，参加生存游戏。
秘密被发现之后，女主干脆都不装了，前往三周目的世界，准备开始新的轮回，只是男主在神使的帮助下，同样去了三周目，找到了女主。
故事的最后，男主让女主杀了他，女主却下不了手，非但没杀男主，反而拿刀自杀。
活下来的男主成了二周目生存游戏最后的幸存者，继承了时空的力量，但二周目的世界已经毁灭。
虽然三周目，在他的干预之下，里面的一些主要角色都过得挺不错了，可以说幸福美满，但二周目的男主，最后却是一个孤独的结局。
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