然后，小智一行人就向空木博士研究所的方向前进着。刚到空木博士研究所的门前就看到有好多警车停在那里，小霞有点好奇地问道：“到底这里发生了什么事？”小刚则发现了前面的君莎小姐，跑上前搭讪道：“君莎小姐，你工作辛苦了！我叫作小刚，我是为了要见你才特地到这里来的，请你多指教！”
小霞立刻就上前将小刚拽走了：“哎！哎！哎！我们的目的不是这个啦！”小智见小刚被拽走，上前对君莎小姐说道：“你好，君莎小姐，我们是来拜访空木博士的。”君莎小姐微笑地回复道：“空木博士就在里面了。”
然后小智一行人就进入研究所内，进到研究所后，就听到了一个自责的声音：“都怪我太大意了，才惹出这种事情来。”乔伊小姐也对那个声音的主人——一个穿着研究员的白色衣服的青年说道：“就是说啊！真是的，你要专心搞研究没有关系。可是，你至少应该为新人训练家考虑一下才对吧？”
小智走向前询问道：“你们好，这里发生了什么事？”乔伊小姐回答道：“这里遭小偷了。”小霞和小刚吃惊地问道：“宝可梦小偷？”君莎小姐走了进来说道：“明天会有新人训练家从这里出发，可是打算给那个新人训练家的小锯鳄却被偷了。”
小霞没有见过小锯鳄，问道：“小锯鳄？”空木博士抱出一只火球鼠说道：“就是明天要跟这只火球鼠一起送给新人训练家的宝可梦了。”小霞看着火球鼠，立刻眼中冒星星：“哇！好可爱啊！”
空木博士终于看到了小智，对小智说：“小智？是你啊！好久不见，你是来挑战成都联盟的吗？”小智点了点头，回答道：“是的，空木博士。”
这时，一位工作人员抱着一块有脚印的石板走了进来，对君莎小姐说道：“君莎小姐，没有采集到可疑人的指纹，但是找到了他们的脚印。”
小智一眼就看出来了：这又是火箭队三人组干出来的好事！于是就说道：“君莎小姐，这是火箭队笨蛋三人组干出来的！”小霞知道了是熟人作案，说道：“君莎小姐，我们知道这是谁干出来的了，请让我们一起去帮忙吧！”小刚也开口说道：“是啊！君莎小姐，让我们一起去吧！”
于是，小智一行人就和君莎小姐一起跟着一只风速狗向前跑去：“风速狗可以从足迹中的残留味道找出对方在什么地方。”
风速狗终于找到了火箭队三人组。不过，火箭队三人组现在正乱成一团糟，小锯鳄还咬在武藏的头上。
小霞看到火箭队三人组后，立刻说道：“火箭队，我就知道是你们！”火箭队也看到了小智一行人，说道：“小鬼头。”
君莎小姐立刻拿出手铐说道：“你们被捕了，火箭队，把小锯鳄交出来！”
“……（火箭队经典登场台词）”说完开场白后，武藏立刻将咬着她头发的小锯鳄甩下来，小次郎也立刻压住小锯鳄，说道：“既然你们让我们交出小锯鳄，那我们偏不交。不仅如此，我们把它培育成最强的坏蛋！”
“你们想得美！小海狮，就决定是你了！”小智派出了小海狮。
“双弹瓦斯，看你的了，用烟幕。”小次郎派出了双弹瓦斯，惯例使用烟幕起手。
“叉字蝠，你去，将烟幕吹散！”小刚派出了叉字蝠来把烟幕吹散。
“小海狮，使用冲浪。”小智也看准时机让小海狮使出了冲浪，然后就看到小海狮乘着海浪向火箭队冲过去，火箭队瞬间变成落汤鸡。小锯鳄也松开了口，顺着海浪来到乔伊小姐怀里。
“可恶！去吧，大食花……都说过多少次了！不要咬我啊！对手在那边。使出藤鞭。”命苦的小次郎又被大食花吞下去了。
“去吧！蚊香蝌蚪，玩水。”小霞也派出蚊香蝌蚪，蚊香蝌蚪的身体周围出现大量的水，不断地被蚊香蝌蚪用尾巴挑起来，形成了一个类似于能量罩的泡泡，大食花的藤鞭只能打起一点水花，无法再进一步地攻击到蚊香蝌蚪。
“大舌头，你去给我把小锯鳄抢回来。”武藏见小次郎的攻击没有效果后，立刻派出了大舌头。
“蚊香蝌蚪，连环巴掌。”小霞立刻下令，然后，蚊香蝌蚪的尾巴就跟大舌头的舌头打在一起，互不相让。
“阿柏怪，你去，使用紧束。”武藏派出了最后一只宝可梦。
“小海狮，急冻光束。”小智见是时候该结束战斗了，就让小海狮放大招，急冻光束朝火箭队攻去，瞬间冻住了火箭队三人组。
君莎小姐也立刻将冰块移走，至于会怎样处置，小智表示：你们能阻止三人组挖地道逃跑再说吧！
事后，小智一行人也和乔伊小姐一起回到宝可梦中心，小智让乔伊小姐帮忙登记参加成都联盟大会之后，拿了成都地区的地图，就向着第一个道馆的所在地——桔梗市的方向前进了。
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