另一边的火箭队看到老大交给他们的飞行船已经变成了废墟，悲痛难受。这回儿又让老大生气了，好在他们又振作起来，知道小智一行人还会回来搭乘飞行船的，便斗志满满。
只要小智等人再次搭乘，他们就有抓捕皮卡丘的机会，只要抓住了皮卡丘，到时候老大一定会开心的，升职加薪便不会遥远了。
他们鼓足干劲，准备修缮这艘飞行船，而内木博士的居所中，内木博士正带着小智三人参观她的后院，她的后院和大木博士家的一样，都是为了让宝可梦能够自然生长而精心打造的。生活了很多有趣的宝可梦，助手们将宝可梦的饲料也准备好了，告诉它们开放了
派拉斯特、霸王花等一众宝可梦听到后，全部一窝蜂的冲上来。小智三人发现这里的宝可梦好像和普通的宝可梦有着些许差距，感到非常奇妙
内木博士点点头，“没错，这就是我的研究主题之一，她正在探寻这里的宝可梦与外界的不同之处”
小刚看到这些宝可梦全部都是内木博士一个人饲养的，被她的容貌和愿景给感动。突然树上的那只巴大蝴又向平时那样不吃饭，小刚发现了它不吃饲料的问题。
他为它重新制作了符合它口味的饲料，巴大蝴吃的十分开心，小刚优秀的饲育能力将内木博士他们给折服，内木博士想邀请小刚帮忙照顾这座小岛的宝可梦
同时小刚的家务能力又将所有人给惊呆了，在内木博士的美人计下，小刚最终败倒在她的石榴裙下，愿意帮助内木博士她们打理整个小岛
小智知道小刚即将要和他们分开，并没有难过。以后还有更多的机会和小刚继续冒险呢。小刚和小智两人告别，小霞有些感伤
小智安慰她，小刚只是暂时待在这而已，很快便会再次相遇的。就这样小刚和小智他们别，小智和小霞离开了岱柑岛
小智两人回到了来时的路，再次领略了南方小岛的风土人情后不由想起那艘来时的飞行船，要是还能飞回去就好了
说着说着，他们发现那艘飞行船已经焕然一新，小智不得不佩服火箭队的动手能力，在他们的改装下，这艘飞行船变得焕然一新，小智两人被乔庄打扮的火箭队热情的推上了飞行船
两人搭乘着飞行船返程，小智再次派出了水箭龟将火箭队两人给打飞，而这艘飞行船带着他们漫无目的飞行着，小智没有阻止。
飞行船漫长的飞行着，终于下降了，他们降落在一座小岛上，小智两人走在陌生的森林中，小智感到十分的奇怪，走了这么久，这座森林一个人影都没有，这是座无人岛吗？
两人开始担忧该如何回去，没有人的帮助，他们可能要被困死在这里。突然草丛中出来很多人，他们都是这里的居民。
这里是澎柑岛，小智两人走到澎柑岛的地界，突然有两名穿着草裙的漂亮大姐姐出现，她们欢迎小智两人的到来，热情的给两人带上花圈，表示欢迎。
这里是澎柑岛的野生宝可梦森林，这里正举办主题公园。看到这里十分热闹，小智两人都非常开心。两人在大街上走着，突然他们望着脚下的沙滩边有只濒危的乘龙
这只乘龙十分虚弱，它的背后有几名小混混正在欺负这只乘龙，小智看到后怎么能忍，他跑上前去阻止他们。
小智和他们发生了口角，对面这三位染着不三不四的装束让小智两人大倒胃口，他们叫嚣着挑战过南十字星，实力可是很强的。
小智才不管他们说的是南十字星，还是北十字星，只要让他看到他们持强临弱，那么他一定不会手下留情的。小智和他们展开了战斗
小智派出了喷火龙，对面的三位不良少年派出了烈雀、艾比郎、大针蜂
小智并不将这三人放在眼中，让喷火龙直接喷射火焰吐过去，就将它们给烧成灰烬，把他们击败了，这三位不良少年被小智击败逃跑了，突然出现了一个少年。
这名少年名叫小健，是一位宝可梦观察家，小健看了下受伤的乘龙，看到它的伤势很严重，赶紧给了小智应急药，让他给乘龙喂药。而他赶紧跑去宝可梦中心将乔伊小姐喊来
乘龙看到小智接近，刚刚被人类欺负的它，对人类充满敌意并不信任，拒绝了小智的好意，好在乔伊小姐及时赶来，将这只受伤的乘龙接到了宝可梦中心。
在宝可梦中心，小智两人和小健都听着乔伊小姐汇报着乘龙的情况，听到这只乘龙已经度过危机后，松了口气。
然后小健和小智攀谈起来，小健告诉小智他是宝可梦观察家，他们谈到这只乘龙时，小智看到小健能一眼看出这只乘龙还是一只孩子，对他十分佩服
这只乘龙应该是被附近的风暴吹散和漂流到这边的，又被这些不良少年欺负让它变得更加胆小，在小智给它喂药时，它坚决拒绝了，这么一说都说通了。
小智三人想要帮助这只小乘龙，让它能找到回家的路。突然有些孩子抱着自己的宝可梦来找乔伊小姐，希望她能够治疗他们的宝可梦，他们嚷嚷着要去挑战南十字星
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