君莎小姐的家族在宝可梦世界有着很强大的影响力，市长不敢太过于得罪君莎小姐。
托君莎小姐的福，小智他们安然无恙的走出了警局。
从君莎小姐的口中，他们得知了原来市长是因为害怕未知生物影响到他一个周后的市长评比，所以就想隐瞒这件事，不让市民们知道。
看到这个市长完全不在乎市民的安全，只在乎自己的权利，小智他们绝对不能忍受。
另一边的市长害怕小智他们走露风声，便派遣信任的手下，准备将小智他们给干掉。
看到市长对市民的不闻不问，小智想为市民办实事。他和小霞他们暂时又来到了下水道，在水下中又发现了那只触手。
然后波克比和皮卡丘对这触手扎进了水中，连带着抱着波克比的小霞也没有幸免于难
看到小霞也被抓进了水中，小智着急了，派出了自己刚刚在宝可梦中心和大木博士置换过来的秘密武器，臭臭泥。
臭臭泥给小智指明了水下未知生物的位置，然后小智跳进了水中了，发现了那只未知生物。
原来那只未知生物就是一只被遗弃的妙蛙种子，它发育的比较优良，体型显得非常大，这只妙蛙种子的身上挂着一个他刚刚看到符号悉的吊坠。
这是他刚刚和小健他们在宝可梦中心和大木博士通完话后，走到公园中的一座市长雕像旁。那只市长雕像下方刻着一个m字型的象征符号。
这只被遗弃的妙蛙种子可能是那个市长的。
然后小智、小霞他们便带着这只妙蛙种子找到了市长，当着市民的面揭穿了市长的阴谋，下一次竞选市长估计是没戏了。
那只巨大的妙蛙种子看到了市长显得很开心，用藤藤鞭高高将他举起，小智告诉他，这是他的妙蛙种子。
望着这只巨大的妙蛙种子，市长回忆起他年幼时曾经遗弃过一只妙蛙种子，没想到这是只蛙种子，就是下水道的那只怪兽。
在众人的目睹下，市长终于还是下课了。妙蛙种子也将由乔伊小姐照顾
乔伊小姐告诉了他们对面的柚子岛就是下一个橘子联盟的道馆，带着小智三人来到附近的邮轮旁，让他们乘船前往。
然后小智三人和乔依小姐和君莎小姐告别，踏上了柚子岛，迎接下一场道馆挑战赛。
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