除了马铠之外，马镫也被桓温应用到了骑兵当中，在西晋之前骑兵是没有马镫的，只有一种类似马镫的帮助上马的器具，这种器具也具有双马镫的一些基本形态，可以供人上马时蹬踏助力，但不能用于骑行过程中的踩踏。
桓温根据后世的经验发明出了现代意义上的，这种双马镫可以供骑兵前进时使用，使得骑士能够借助腿力保持身体稳定，即使高速冲锋时也不必再手抓缰身，同时还可以在马镫上站力，使骑士得以发挥全身力量进行格斗。这件装具的出现，极大的提高了骑兵的作战效能。
北府军除了步骑之外，桓温还建立了强大的水军，这与大型楼船的出现密不可分。西晋时水军便已有发展，西晋灭吴前，抚远大将军王濬就曾在蜀地大造楼船，楼船顺流而下，直到下游还能看到。
东晋南渡后，造船和使船的技术更加完善。在桓温的大力支持与推动下，北府军也大规模建造了能容纳多达2000人的大型楼船。这种大型船只大多在内河航运，一则体积巨大，防护能力强；二则运输能力强，不论运送兵力还是输送后勤补给物资，都是陆地交通效率的数倍。
此外，桓温还根据自己的经验跟工匠们一起研究出了车船。车船使用了轮桨，轮桨与旧式直桨相比有很多优点。一是动力连续。直桨划水时，在桨出水时没有动力，而轮桨可以连续产生动力。二是协作容易。直桨船要增加动力，必须尽量多地配置人力，但是直桨越多，多人同时划桨，很难做到步调一致，造成人力浪费，而轮桨连续转动，不存在协同和人力浪费问题，极大提高了动力输出效率。
桓温之所以发明车船主要也是看到了传统楼船的缺点，那就是无法在大海里航行，桓温另一个隐藏在内心的想法就是待打败胡人实现天下一统之后，桓温也想派船前往台湾、琉球、苏禄、占城、爪哇以及那可恶之极的倭国去，早早在哪里建立起稳定的统治，也方便后世再出现领土纠纷之时，我们也可以有史可依，可以理直气壮的喊出哪句着名的“自古以来…”
强大的武器装备再加上超高素质的兵源，北府兵可以说已经是当时顶级的军队了，此时的北府兵就像一只待在笼子里的已经武装到牙齿的老虎，待到时机成熟，就会像猛虎下山一般威震天下了。
有了这支部队的加持，再加上东晋中央及地方已经完全被桓温掌控，通过土断又积累了大量的财富，解决了困扰朝廷多年的社会矛盾，同时也严重打击了士族的势力，扶持了寒族的崛起。
此时的东晋内部可以说是已经十分稳固，寒族阶层是绝对支持桓温，士族阶层也已分化严重，一部分彻底倒向了桓温，剩下的一部分即便是没有倒向桓温也绝对不会再敢捣乱了，这也就保证了不会再出现有人挚肘的事情了。
巨大的成就和绝对的掌控力让桓温冥冥中觉得，组织第三次北伐，一举统天下的时机已经成熟了。
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