为了救灵儿，李逍遥去女娲庙，并被女娲娘娘送回十年前。他回到十年前南诏国皇后、灵儿母亲被公审判刑的那一天。灵儿的母亲让他把灵儿带走。他打算改变历史，把灵儿和姥姥带去与仙灵岛方位相反的地方。可惜飞行太久，环绕地球，再次回到了仙灵岛也不知道。
他叮嘱十年前的酒剑仙，千万不要教李逍遥武功。可是酒剑仙的性格就是那样，他就偏偏给十年后的李逍遥传授了蜀山功夫。等李逍遥集齐灵珠、麒麟角、凤凰蛋以后，他回到十年后，却发现一切都没有改变。这就是命。
灵儿和众人一起说服巫王下令铲除拜月教，但是受制于万民的压力，只能收回成命。灵儿终于诞下一女，众人欣喜不已。逍遥和灵儿两人给孩子取名“忆如”。同时，逍遥和灵儿也完成了最后一个心愿——拜堂成亲。
受拜月派遣，得知表妹林月如惨死锁妖塔后，晋元约逍遥一起比武决斗。当逍遥与晋元约战的时候，被晋元刺死和抢走灵珠。原来晋元刺中了逍遥心房的不死劫，短暂假死后就可以再次复活的，这样晋元就可以完全取得拜月教主的信任了。后来，晋元还是被拜月教主给杀害了。弥留之际，他告知了玉坠的秘密。
那个被灵儿母亲用生命镇压的水魔兽被拜月唤醒了，南诏国水淹四方，而拜月教徒四处屠戮，民生危急的关头，逍遥和灵儿前去阻止。
灵儿不顾前路凶险，留下保护南诏国子民，逍遥问灵儿，非如此不可吗，灵儿答，非如此不可。
面对拜月教的阴谋，逍遥和灵儿已经做好了牺牲的准备。无奈，与拜月教主的较量中，他的武功出神入化，哪怕是逍遥和灵儿的俩人联手，也不是他的对手。阿奴和唐钰两人依照传说中使用吊坠化为比翼鸟，拜月在吊坠的作用下，终于意识到了爱的存在，逍遥借这个机会一招把拜月毙杀了。
拜月教主虽然死了，但水魔兽依旧在肆虐南诏国，逍遥和灵儿再次陷入恶战之中。为了一绝后患，保卫家园，灵儿只好拼死冲进水魔兽的体内，彻底把它瓦解了。逍遥本来以为灵儿肯定已经死了。正当他悲伤的时候，灵儿从水中缓缓升起，宛若仙子，逍遥立刻高兴起来。当他以为可以和灵儿长相厮守时，有说有笑的时候，才发现灵儿的血越流越多，灵儿也受了重伤。但灵儿坚持着回到逍遥的身边，强留的一口气终于耗尽了，最后死在逍遥怀中。
最后，李逍遥抱着女儿忆如，质问剑圣：你明白吗？他拒绝入剑圣的道，非常决绝离去了。
李逍遥的理想是成为一代大侠，经历了那么多次战斗，其实他实现了自己的理想。在他恢复记忆之后，他不断地跟宿命和天道抗争，可结果似乎仍是命由天定；为了救灵儿想改变过去，也没能改变整个故事的结局；打败了拜月教主却也没有保住灵儿，没有等来灵儿相守相伴。
赵灵儿看着天真、柔弱又无知，其实她有着深不见底的潜力，不可估量的勇气以及橙明的心境。作为女娲后人，就有以拯救万民为自己的责任。尽管被污蔑成亵渎神灵的女妖，还是义无反顾，为自己的子民，甘愿牺牲。
李逍遥和赵灵儿的爱情，因为缘分的让他们相遇，但命运也让他们分离，使命注定不是简单的分离，而是天人永隔。因为女娲后人之路都不容易，它是一场注定要牺牲的旅途。一开始以为，那么多人都牺牲了，也许可以换来他们自己的幸福。可惜，上天对女娲后人还是太残忍了。
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