三月十日，就在宋军开始撤退时，朱棣也率兵驻扎龙潭（距应天仅30公里），建文帝大惊，连忙问群臣怎么办？
方孝孺神色凝重地道：“陛下，如今京师尚有将近二十万雄师，尚可与之一战。我们可以先派遣使者前去同朱棣交涉谈判，借此拖延时间，而后等待各地援军赶来增援。”
“甚好，便按你所言行事吧！”建文帝一脸疲态，有气无力地道。
紧接着，建文帝派遣李景隆等大臣前往与朱棣谈判，并表示愿意割舍部分土地以示诚意。然而，朱棣的态度依旧坚决如铁：“我所求者唯有奸臣而已，绝无造反之意！”
眼见谈判陷入僵局毫无成果，建文帝无奈之下只得命令各诸侯王及将领率领军队坚守城池。
三月十八日，朱棣统率着浩荡大军抵达应天城下。守卫金川门的李景隆竟然打开城门，向朱棣投降。朱棣的军队得以长驱直入，顺利攻入城中。然而，当朱棣进入城内时，却惊见皇宫燃起熊熊大火，建文帝的身影早已消失无踪。
朱棣在群臣的拥戴下，于 1402 年正式登基称帝，继承大统，定年号为永乐。即位之后，朱棣一方面着手整顿朝纲、稳定政局，另一方面则迅速调遣兵马出征浙江。没想到大军抵达浙江后，却发现这里已是空无一人（字面意义上）。
而宋明之间的博弈也真正开始！
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