随着超凡蜘蛛侠二的播放结束，一直没有行动的帕克也开始行动起来去寻找古斯塔夫·菲尔斯这个隐藏在幕后的黑手。
虽然公司依旧处于动荡时期，但哈利仍然选择帮助帕克调查绅士可能存在的秘密基地，以及通过奥斯本工业的智能AI查找他与麦肯的关系。
而麦肯在看到天幕中古斯塔夫·菲尔斯被半曝光之后，也是放弃了最后的那一丝希望，他原本还寄希望于对方能将他救出来，毕竟双方还是合作关系。
没想到绅士自己也自身难保了，这下子麦肯是感觉自己彻底没希望了，于是果断卖了绅士，将他所有知道的信息都透露给了FBI，以换取更好的待遇。
同时也算是避免了肉身之苦，因为FBI的人员过去好几天了依旧没抓到绅士，已经开始有点急不可耐了。
外界对于菲尔斯这个人相当好奇，要求尽快查出并将其逮捕，这种邪恶的野心家留在外面一天，他们就得担惊受怕一天！
迫于舆论压力，麦肯觉得他再不说的话，估计FBI要上刑了，本来按照麦肯的身份这种事情是不可能发生的，但架不住FBI因为拉吉特拉塔的事情对他恨之入骨。
若不是顾忌一些舆论，担心被对手污蔑他们是屈打成招，麦肯不可能直到现在还活得好好的！
绅士的身份随着麦肯的自首彻底曝光，当FBI的工作人员借由乔治的口宣布出来后，绅士的公司Oscorp就遭到了围攻。
由于他的不知所踪，于是警方直接将其定位畏罪潜逃，并在其公司内发现了许多违法的实验与研究，一时间整个公司的情况也是急转直下。
股票连续多次跌停，员工们也是人心惶惶不可终日，因为时不时就有工作人员被FBI的人带走去调查。
同时阿列克谢西斯艾维奇也被墨西哥政府遣送到了美利坚，被FBI接收并直接送到了另一所秘密监狱直接关押了起来。
由于考虑到他的危险性，这座监狱距离纽约并不远，这样就算他再逃出来，蜘蛛情侣也能很快抓住他。
同时还有很多的市民担心奥斯本工业内的那些可怕的装备武器被向菲尔斯这样的野心家使用。
哈利也是站了出来表示自己将会加大对于特殊项目的安保措施，绝不让其被小人夺走！
帕克与格温也出来替哈利做担保，出于对蜘蛛侠的信任，舆论热度持续了半个多月后就缓缓降低了下来。
菲尔斯也在潜逃了十多天后终于在纽约某个秘密地点被抓住了，因为他本身并不具备超能力，因为面对FBI人员的枪口，他只能选择乖乖投降。
野心还没开始就直接破灭了，也不知道他是否会后悔自己为何要如此贪心？
在逮捕了菲尔斯这个最大的幕后黑手后，FBI纽约分局局长终于是亲自召开了新闻发布会，对于拉吉特拉塔被灭口事件以及幕后的麦肯和菲尔斯这两名罪大恶极人员做出了回应。
帕克也在见过麦肯后知道了他的父母当年所有事情的始末，可惜逝者已逝，他的父母再也回不来了。（就让理查德帕克与玛丽帕克在一起吧）
当一切都尘埃落定之时，时间也恰好过去了三个月，天幕再度开启。
【“各位好啊！前面我们看到了初代与二代彼得帕克的故事，现在让我们看看三代蜘蛛侠的故事吧！不过要了解三代，就要先知道一些其他人！”旁白的声音响起。】
“直接就是第三代了吗？二代的故事这就完了？那神秘黑手呢？阿列克谢西斯艾维奇还有哈利的结局呢？”托尼皱起了眉头，疑惑地看着天幕。
“什么情况？”托比蛛以及加菲蛛他们也是不明所以得看着天幕，希望能获得一个解释。
“嘿！什么情况啊？二代的故事明明还没有结束，怎么就播放第三代了啊！还有要知道其他人是什么人？”
托尼对着天幕大声呐喊着，但天幕没有理会众人们的疑惑，自顾自地说道：
【“众所周知，初代蜘蛛精，二代蜘蛛侠，三代家父。。。钢铁侠！！！”】PS：照例托比蛛，加菲蛛区分。
【“与初代和二代不同，三代蜘蛛侠的各项能力都较为均衡，但相比较于其他两代，他更突出的是科研能力！”】
【“依靠着来自托尼斯塔克的科技传承，令他哪怕不将自己的能力完全开发出来，依旧有着超强的战斗能力！”】
【“只是认识的能人异士实在太多，反而让他在遇到困难时不会想到靠自己解决，而是寻求帮助，太过于依赖他人以至于无法发挥出自己应有的能力，就连蜘蛛感应都是时有时无！”】
托尼：“？！！这个钢铁侠是我知道的那个钢铁侠吗？我？！！”托尼摊开双手不可置信的望着天幕。
尼克弗瑞瞪大了眼睛看着天幕，立即选择给托尼打了个电话，他怎么不知道托尼还有一个儿子呢？
接到电话的托尼也是一脸懵逼，难道说自己还有一个私生子？不可能啊！虽然他以前确实很风流，但也很确定自己不会有私生子什么的流传在外。
但是现在他开始怀疑了，天幕不会无矢放的，他说是就肯定是，人家没必要在这一点上骗自己。
“佩珀，你听我解释！我真的不知道我有个儿子！”托尼看到佩珀一脸冷意地转头走了出去，他连忙挂断电话，慌慌张张地追上去解释。
但佩珀现在突然知道托尼会有个儿子是蜘蛛侠，而且很大概率不会是自己生的，愤怒值直接拉满了变成小辣椒了。
托尼死死拉着佩珀的手，不让她离开别墅，好说歹说才让她略微平息了怒火，没有一气之下直接跟托尼分手。
“钢铁侠？那个托尼斯塔克？以凡人之躯，比肩神明的那个？！！”一时间众多围观天幕的人们都有点不可思议。
按照前两位蜘蛛侠的情况来看，第三代应该也叫彼得帕克才对，为什么他的父亲是托尼斯塔克？这不合理啊！怎么没跟斯塔克姓？还是说是领养的？
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