梁山接受朝廷招安之后，燕青便跟随宋江开始了南征北战的生涯，而他所归属的则是卢俊义的麾下。
在征讨辽国的时候，战况异常激烈。当大军行进至玉田县之时，只见敌军阵营中有一员猛将，正是耶律宗云。此人勇猛无比，给宋军造成了不小的压力。然而，燕青临危不惧，手持弩箭，目光如炬地瞄准了耶律宗云。只听“嗖”的一声，弩箭如同闪电一般疾驰而去，精准无误地射中了耶律宗云，使其当场毙命。这一箭不仅展现出了燕青高超的射术，更是大大鼓舞了宋军的士气。此后，燕青又跟随卢俊义一路势如破竹，成功攻破了那令人生畏的太乙混天象阵。
待大军班师回朝之际，行至双林镇时，燕青竟意外地与昔日好友许贯忠重逢。两人相见甚欢，彼此诉说着分别后的经历和思念之情。临别之时，许贯忠慷慨地将一幅珍贵的三晋山川城池关隘图赠予燕青，这份礼物对于日后的征战无疑具有重要意义。
待到征讨田虎之时，尽管燕青在此役中并未有特别耀眼的突出战绩，但他曾经向军队进献过那份至关重要的三晋地图，为作战计划的制定提供了关键的参考依据，也算是立下了一份不可磨灭的功劳。
在征讨王庆期间，战况激烈，硝烟弥漫。当大军行至龙门关之前，燕青敏锐地察觉到了战局中的潜在危机。他深知此役艰险异常，于是赶忙劝谏卢俊义，言辞恳切地劝其切勿亲身涉险、亲临战阵。然而，卢俊义却并未听从燕青的建议，执意要亲自上阵指挥作战。
眼见无法改变卢俊义的决定，燕青并未气馁，而是迅速采取行动以应对可能出现的不利局面。他果断调集五百名精锐步兵，带领他们火速赶往平泉桥附近。到达目的地后，燕青身先士卒，指挥士兵们砍伐周围的树木，并巧妙利用这些木材搭建起一座坚固的浮桥。
果不其然，战场上风云突变，卢俊义所率军队在交战中遭遇失利。敌军如潮水般汹涌而至，气势汹汹。混乱之中，平泉桥不堪重负，最终被蜂拥而来的乱军生生压塌。就在这千钧一发之际，多亏了燕青先前搭建的那座浮桥发挥了关键作用。它成为了大军撤退的唯一通道，使得众人能够顺利通过，从而避免了全军覆没的悲惨结局。可以说，正是因为燕青的深谋远虑和果敢决断，才保住了这支队伍的有生力量。
待到征讨方腊之时，局势更是错综复杂，充满变数。燕青再次挺身而出，凭借着机智灵活的头脑屡立奇功。一次，他乔装改扮成吕师囊帐前的虞候，与解珍、解宝二人协同合作，一同混入扬州城外的定浦村中。他们暗中查探情报，寻找时机。终于，在发现了陈观父子与叛军相互勾结的证据之后，三人毫不犹豫地出手，干净利落地将这对罪大恶极之人斩杀于剑下。
此后，燕青又化名为云壁，跟随柴进一同假意投降方腊一方。他们深入敌营，小心翼翼地隐藏自己的真实身份，等待着最佳时机的到来。在清溪之战中，燕青与柴进密切配合，瞅准时机突然在阵前倒戈相向。两人合力出击，奋勇杀敌，尤其是燕青身手矫健，剑法凌厉，瞬间便将敌将方杰斩落马下。他们的举动令方腊军队猝不及防，顿时陷入一片混乱。趁此机会，宋军乘胜追击，势如破竹，一路攻入了帮源洞中，给方腊势力造成了沉重打击。
梁山军历经无数场激烈的战斗之后，终于成功地平定了方腊之乱。硝烟散去，胜利的喜悦洋溢在每一个将士的脸上。然而，这看似圆满的结局背后，却隐藏着一场即将到来的风波。
在大军凯旋而归、班师回朝之际，燕青悄悄地来到了卢俊义的营帐前。这位智勇双全的好汉面色凝重，心中怀揣着对未来深深的忧虑。进入营帐后，燕青诚恳地劝说卢俊义趁此机会急流勇退，放下一切功名利禄，隐姓埋名去过平静的生活，如此方能安享天年。
卢俊义听后，微微摇头，表示自己不愿就此放弃眼前的荣华富贵和荣耀地位。燕青见状，并未气馁，而是继续苦口婆心地以汉高祖刘邦在建立汉朝后大肆杀戮功臣为例，警示卢俊义伴君如伴虎，若不及时抽身离去，恐有杀身之祸。
可惜，卢俊义心意已决，任凭燕青如何劝谏，都坚决不肯听从。面对固执己见的卢俊义，燕青无奈地长叹一声，眼中满是失望与惋惜。最终，他决定不再强求，深深地向卢俊义拜别。临行之前，燕青还特意留下一封书信给宋江，将自己的想法和担忧一一倾诉其中。
就在那个寂静的夜晚，燕青独自一人挑起满满一筐价值连城的珠宝，悄然离开了梁山军。他的身影消失在了茫茫夜色之中，从此杳无音信，不知所踪。而那筐珠宝，则成为了他留给世人最后的一点痕迹，仿佛在诉说着这段充满传奇色彩的故事。
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