击退黑衣人入侵后，宇宙灵能学府并未因暂时的胜利而放松警惕。小宇澄、陆景琛和叶灵犀全身心投入到对神秘黑暗组织的调查之中。他们仔细研究黑衣人留下的每一丝线索，从残留的灵能波动到特殊的符号标记，不放过任何一个细节。
小宇澄通过对黑衣人灵能波动的分析，发现其与一种古老的黑暗灵能修炼体系有关。这种体系曾在宇宙历史的长河中被视为禁忌，因为它以牺牲生命和破坏宇宙平衡为代价来换取力量。为了进一步了解这个黑暗组织，小宇澄决定前往星际灵能联盟的档案馆，那里收藏着宇宙中最全面的灵能历史资料。
在星际灵能联盟的档案馆内，小宇澄花费了数天时间，翻阅了无数古老的典籍和文献。终于，他在一本尘封已久的古籍中找到了一些关键线索。古籍中记载了一个名为“暗影议会”的组织，他们崇拜黑暗力量，妄图通过唤醒沉睡的黑暗魔神来统治宇宙。这个组织在数千年前曾被宇宙中各大灵能势力联合围剿，几乎被消灭殆尽，但没想到如今又死灰复燃。
小宇澄带着这些重要线索回到学府，与陆景琛、叶灵犀以及星际灵能联盟的高层共同商讨应对之策。经过激烈的讨论，他们决定成立一个特别行动小组，深入调查“暗影议会”的踪迹，并在其实施邪恶计划之前将其摧毁。小宇澄凭借着丰富的冒险经验和强大的灵能实力，理所当然地成为了行动小组的核心成员。
行动小组首先来到了黑衣人入侵学府前最后出现的星球——墨渊星。这颗星球被浓厚的黑色雾气所笼罩，表面充满了废弃的灵能设施和破败的建筑，散发着一股阴森的气息。小宇澄等人小心翼翼地降落在星球上，立刻感受到了一股压抑的黑暗灵能波动。
他们沿着黑衣人留下的模糊踪迹前行，途中遭遇了各种黑暗灵能陷阱和守护兽的攻击。这些守护兽身形巨大，浑身散发着邪恶的气息，它们对入侵者毫不留情地发动攻击。小宇澄施展出“混沌星芒风暴”，与守护兽展开激烈战斗。在他的带领下，行动小组的成员们各自发挥所长，有的用强大的灵能护盾抵挡攻击，有的施展远程灵能攻击，逐渐将守护兽击退。
经过一番艰难的探索，他们终于在墨渊星的深处发现了一个隐藏的地下基地。基地的入口被一层强大的黑暗灵能护盾所保护，小宇澄尝试用各种方法破解护盾，但都没有成功。就在众人一筹莫展之际，行动小组中的一位灵能技术专家通过对护盾能量频率的分析，找到了破解的方法。
他们成功进入基地，里面阴暗潮湿，通道错综复杂。小宇澄等人分成几个小队，分别探索不同的区域。在一个房间里，小宇澄发现了一些奇怪的实验设备和记录，上面记载着“暗影议会”的一些邪恶实验，他们试图通过融合黑暗灵能与生物基因，创造出强大的黑暗生物武器。
在另一个区域，陆景琛带领的小队遭遇了一群黑暗灵能战士的伏击。黑暗灵能战士们训练有素，他们紧密配合，施展出强大的黑暗灵能攻击。陆景琛冷静地指挥队员们，利用地形和灵能技能进行反击。他施展出自己独特的灵能剑法，一道道凌厉的灵能剑气纵横交错，将黑暗灵能战士们打得节节败退。
与此同时，叶灵犀带领的小队在基地的核心区域发现了一个巨大的黑暗灵能传送阵。这个传送阵散发着诡异的光芒，似乎连接着某个神秘的地方。叶灵犀意识到，这个传送阵可能是“暗影议会”进行大规模黑暗力量传输的关键设备。
就在他们准备进一步研究传送阵时，基地突然响起了刺耳的警报声。原来，他们的行动触发了敌人的防御机制，大批的黑暗灵能战士正朝着核心区域赶来。小宇澄等人迅速汇合，准备迎接敌人的攻击。
黑暗灵能战士们如潮水般涌来，小宇澄站在队伍前方，大声喊道：“大家稳住，不要慌乱！按照预定战术行动！”他施展出“混沌破界冲击”，冲向敌人，为队友们开辟出一条道路。其他队员们则紧密配合，有的施展防御技能，保护队友不受伤害；有的发射强大的灵能炮弹，对敌人进行远程打击。
在激烈的战斗中，小宇澄发现敌人的攻击似乎在有意掩护传送阵的启动。他心中一惊，意识到“暗影议会”可能正在通过传送阵召唤某种强大的黑暗力量。他当机立断，决定带领几个队员冲向传送阵，阻止其启动。
小宇澄和队员们在敌人的重重包围下，艰难地朝着传送阵前进。他们不断遭受黑暗灵能的攻击，但凭借着顽强的意志和强大的灵能实力，一次次突破敌人的防线。终于，他们来到了传送阵前。
小宇澄发现传送阵已经启动了一半，黑色的光芒在阵中闪烁，一股强大而邪恶的力量正在逐渐凝聚。他知道，时间紧迫，必须立刻破坏传送阵。他集中全部的灵能，与队员们一起施展出最强的攻击，朝着传送阵轰去。
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