当她带着零件回到飞船，却发现飞船的自动修复系统突然失灵，一些原本可以自行修复的小损伤不断恶化。苏瑶不得不手动排查故障，她发现是之前与海盗战斗时遭受的电磁冲击，导致修复系统的程序出现错乱。她逐行检查代码，重新校准参数，耗费了大量时间才让自动修复系统恢复正常。
在修复武器系统时，零件与武器系统又出现新的兼容性问题。这次不仅接口和能量输出有偏差，零件还会与武器系统的智能控制系统产生冲突，导致系统频繁报错。苏瑶运用专业知识，重新编写武器系统的控制程序，调整零件与系统的交互逻辑。她连续工作数小时，眼睛布满血丝，终于成功修复武器系统。再次启动飞船，苏瑶踏上回家旅程。
飞船即将抵达基地时，苏瑶发现基地周围空间异常波动愈发强烈。检测后发现，能量风暴引发了空间紊乱，出现多个小型黑洞，不断吞噬周围物质。基地的防御系统因空间紊乱，部分功能失效，能量护盾也因空间扭曲出现裂缝。苏瑶驾驶飞船靠近基地时，被黑洞的引力场拉扯，飞船剧烈摇晃，操控系统失灵。她紧急启动备用动力，利用飞船的推进器调整角度，才勉强脱离引力场。而此时，飞船的生命维持系统也出现故障，氧气供应逐渐减少。苏瑶一边要应对外部的危险，一边还要在有限时间内修复生命维持系统。她迅速排查故障，发现是关键线路被引力拉扯损坏。她冒险在飞船外部进行修复，在微流星体和不稳定引力场的双重威胁下，成功修复线路，确保了氧气供应。
然而，一波未平一波又起。基地附近的空间紊乱还导致了一种奇异的能量逆流现象，这种逆流会干扰飞船的能量传输线路，使飞船的能源供应变得不稳定。苏瑶不得不再次对飞船的能源系统进行紧急调整。她利用飞船上的备用能源模块，重新规划能量传输路径，绕过受影响的线路。在调整过程中，她还需要时刻警惕能量逆流可能引发的突发状况。
苏瑶与基地工作人员联系，共同制定应对方案。他们发现小型黑洞的产生与能量风暴的特定频率共振有关。苏瑶利用飞船的能量调制设备，发射出反向频率的能量波，试图抵消共振。但在发射过程中，能量波受到空间紊乱干扰，出现波动异常。苏瑶不断调整能量波的参数，经过多次尝试，终于成功抵消共振，小型黑洞逐渐消失。接着，她协助基地修复防御系统，将飞船能量护盾与基地防御系统重新连接，稳定住基地的能量护盾。
就在基地防御系统逐渐恢复正常时，苏瑶又收到了基地内部发出的警报。原来，由于之前的空间紊乱，基地的安全防护系统出现漏洞，一些危险的外来微生物趁机入侵。这些微生物具有极强的腐蚀性，正在对基地的设施造成严重破坏。苏瑶顾不上休息，立刻投入到应对微生物入侵的工作中。她和基地的科研人员一起，分析微生物的特性，研发出一种针对性的抑制药剂。在大家的共同努力下，终于成功抑制了微生物的扩散，修复了基地的安全防护系统。
但修复安全防护系统后，基地的能源分配系统又出现故障，导致部分重要设备无法正常运行。苏瑶和基地人员紧急检查线路和控制中枢，发现是空间紊乱引发的电磁脉冲损坏了能源分配系统的核心控制芯片。他们在基地的备用零件库中寻找可替代的芯片，却发现型号不匹配。苏瑶凭借自己的技术知识，对芯片进行改造，经过反复调试，成功让能源分配系统恢复正常。
解决能源分配系统问题后，苏瑶准备提交任务成果。这时，星际考古协会通知她，由于任务过程中涉及到对神秘星球生态和遗迹的潜在影响，需要进行全面评估。苏瑶不得不再次梳理整个任务流程，收集相关数据，撰写详细的影响评估报告。她仔细回忆在神秘星球的每一个行动细节，分析对当地环境、生物以及遗迹稳定性的影响。
在撰写报告时，数据传输突然中断，疑似受到未知信号干扰。苏瑶重新连接线路，检查通讯设备，却发现干扰源来自基地内部的一个实验装置。这个装置正在进行一项高能物理实验，产生的特殊电磁波与数据传输频段相互干扰。苏瑶与实验人员沟通协调，调整实验参数，最终恢复了数据传输。
完成影响评估报告后，苏瑶终于将文物和研究成果正式交给星际考古协会。协会成员们仔细检查文物，认真研读她的研究报告，对她的成果赞不绝口。就在这时，她脑海响起系统提示音：“任务完成，获得400积分。”
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