在古代海上进行大规模的海上作战，船团面临的最大的问题就是指挥和配合的问题，而这方面于孝天说实在的最初只是门外汉，虽然他也意识到了以后会遇上这样的问题，提前设计了一套简易旗语，可是这并没有彻底解决海上作战时候的指挥问题。
小规模编队的时候，旗语还可以比较有效的对船队进行指挥，但是大规模海上编队的时候，一个船团会散布开非常大的面积，有时候船只之间也可能相互遮挡，使得有些船无法看到帅船上打出的旗语。
所以复杂的旗语在这个时候并不能有效的解决指挥问题，相反还可能因为传递信息量过大，而影响到实际的效果，制造出更大的混乱。
后来海狼还是找到了一个曾经在官军水师干过的人，从他那里了解了一些海上交战时候官方水师指挥作战的办法，这时代海上大规模交战，最主要的指挥手段无外乎就是旗号、鼓号和号炮，有时候会采用响镝或者火箭来辅助。
于是于孝天和手下头领们便利用这些已知的东西这段时间进行了不断的编制，以各色不同的令旗来代表不同的含义，或者以悬挂红色的灯笼，数量不同的灯笼代表不同的含义，辅以号炮和旗语进行辅助，编排出了一套新的传令方式。
如此一来，大致上解决了在大规模海上作战的时候，帅船对船团其它船只的有效指挥的问题，在确定了新的指挥方式之后，海狼的船团便进行了普及，确保每条船上的船长、大副还有上斗等人，都能有效读懂这些信号的含义。
然后这段时间海狼在出海训练的时候，主要便进行的是指挥和配合这方面的演练，不断的让船团在海上变换阵型，解决相互间配合的问题。
而且海狼还是以三个分船队为基础，全体作战的时候，以帅船为主，同时各分船队还设有一条备用帅船，一旦帅船出问题的话，另外两条备用帅船可以随时根据情况或者帅船的命令，接管指挥权，升起帅旗继续指挥船团进行作战。
当船团分开之后，这备用帅船也就成为了分船队的帅船，可以升起分船队的帅旗，对其麾下的船只进行指挥作战，这么一来海狼船团的指挥和配合问题便基本上得以解决，不会再出现刚刚开始整训时候那种指挥失灵，配合混乱的情况了。
这一点对于海狼集团来说，尤为重要，使之可以在海上比对手更加指挥灵活，发挥出更大的战斗力。
另外海狼的船团重点还是演练了他们现在独有的线形队列，另外于孝天还在前段时间再次搞出一个人字形的阵列队形，因为这种队形较之长纵列队形来说，一是短时间可以向两翼输送更多火力，充分发挥船队的突击能力，二是可以比纵列队形更容易撕裂对方船阵，指挥起来更加灵活一些，比较适合大规模船团会战，三是船队可以在更短时间之内，在撕裂对方船团之后，集中力量或者分出一部分力量，将敌方被分割开的船队包围，更好的消灭敌方，在局部可以形成船只数量和火力上的优势。
近期经过几次演练之后，王宏等人对于这种人字形也就是倒v形队列的效果反应良好，认为这种队形具有相当不错的实际操作性，并且初步定下了一旦和褚彩老的船团发生会战的时候，便采用这种队形。
除此之外，于孝天还在这两个月间，还为这次即将发生的会战，为褚彩老准备了一份大礼，只待褚彩老大举来犯了。
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