花妖师全部都是女性，而药师大约70％是女性30％是男性。
相同点，他们都是“人木共生修炼”。
不同点，药师前期使命是培育灵药，终极使命是化身成天地灵药。而花妖师并不以培育灵药为职业，至始至终都是人木共生修炼，最终成就花妖体。
药师一般都会远离杀戮，避免沾染血煞因果业力，并且自身战斗力杀伤力薄弱。而花妖师则不同，她们并不受此影响，虽然因果业力不可避免，但是她们又不需要培育灵药，所以少了很多顾忌。特别是彼岸花妖师，更是依靠吸收修士精血而成长，即便是业火燃烧也能通过忍受，破而后立。
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