秦桧弄权，赵构其实洞若观火、心如明镜，只不过，赵构的底线是，相权决不能威胁皇权，而秦桧也深谙个中深浅，始终不敢踩红线，因此赵构对秦桧的种种弄权行为，采取睁一只眼闭一只眼的态度。
秦桧弄权，无非从两个方面着手，一是提拔自己亲信，二是打击自己政敌。秦桧推荐提拔亲信，赵构为照顾秦桧脸面，几乎一概予以批准；秦桧打击政敌，无外乎打着政敌诽谤朝廷，怨望君主等旗号，赵构不得不批准。秦桧死后，赵构立即着手清除秦桧这两方面留下的余毒，可谓雷霆出击、犁庭扫穴。
秦桧死的当日，赵构任命签书枢密院事汤思退兼任代理参知政事，行使宰相之之职，此时的参知政事有两位，一是董德元、二是汤思退。
那么赵构为什么用汤思退？汤思退除了属于坚定的主和派之外，还有一个原因。秦桧死前，曾招董德元及汤思退到自己的卧室，对他们嘱托后事，其后各赠送黄金千两。董德元寻思，不接受的话，秦桧病好，岂不怀疑他有二心？因此不敢推辞；而汤思退的想法却不一样，他知道秦桧多疑，他想，假如秦桧病好了，定将说，我用黄金试探你，你果然希望我早死，所以汤思退不敢收。
问题是，这件事赵构很快知道了（由此可见赵构眼线之多，消息之灵通，情报之准确），赵构可不是汤思退肚里的蛔虫，自然不清楚汤思退的内心想法，他只认结果，汤思退没收金子，所以赵构认为汤思退不是秦桧一路的，因此对他增加了信任感，从而有此任命。而董德元，两个月后就罢免了。
秦桧死后第二天，赵构下诏，直接开除秦桧的姻亲户部侍郎兼临安府曹泳，安置在新州。第二年正月，移送崖州（海南三亚）地方官管制。临安府形同北宋开封府，位置极端重要，赵构如鲠在喉。可见赵构对曹泳有多厌恶，又有多迫不及待，而且下手也极重！
同日，鸿胪寺少卿朱敦儒及朝廷官员薛仲邕、王彦傅、杜思旦因为依附秦桧，全部撤职。赵构还命有关机构将近来被外任、贬职或流放的执政官、侍从官姓名、职位整理上报于他。显然是欲为他们平反的意思。
五天后，秦桧死党殿中侍御史徐嘉、右正言张扶贬职出京，秦桧死前一天，这两人还收秦熺所托，欲上疏奏请秦熺为宰相。赵构没下杀手，已是格外恩典了。
十一月初，赵构将赵汾、张祁释放，秦桧死前打算利用两人兴起大狱，关押在大理寺，所幸秦桧提前见了阎王。十一月二十一日，赵构恢复洪皓“敷文阁直学士”的官职，洪皓出使金国，受尽磨难，回国后以为否极泰来，熟料受秦桧打压，辗转多地，却在秦桧死前一天病故，未能迎来雨过天晴的日子，良可叹息！
二十六日，赵构下诏命各朝廷各机构、下属各州郡，事无巨细，都需要向他奏报，而不能像以前一样，仅上报到尚书省。赵构的意思很明确，以前宰相秦桧代理我处理政事，我乐得做甩手掌柜，现秦桧死了，我事必亲躬。
二十七日，赵构将知建康府王会免职，王会是秦桧妻子王氏之弟，乃秦桧小舅子，不免他免谁？一同免职的还有王晌、王畴、郑侨年、郑震、方滋等。王晌、王畴都是王氏堂兄弟，郑侨年、郑震、方滋也是秦桧转弯抹角的亲属，免职在所当然。而王会在十二月因“恃权贪横”的罪名，流放循州管制，第二年十月再流放琼州管制。
十二月，赵构下诏让张浚、折彦质、万俟卨、段拂、胡铨、胡寅、张九成等三十几人“听其自便”，也就是说，不再接受地方官的管制了，李光从海南移至郴州。有部分恢复官职。而万俟卨因为是主和派，且和秦桧争论过，赵构认为他和秦桧不是一路的，没几天，万俟卨升为资政殿学士兼侍读，再升为参知政事，第二年五月，竟做了宰相。
十二月初五日，秦桧提拔的亲属资政殿大学士郑亿年贬为建武军节度副使，安置在南安军。秦桧的打手莫汲、汪召锡、陆升之等九人开除，流放广南等各州。
公元1156年正月，赵构再下诏，恢复已经过世的赵鼎、孙近、郑刚中、汪藻的官职。
赵构紧锣密鼓地打击秦桧余党，可仍有人垂死挣扎，二月，传言秦桧的私生子右朝奉郎林一飞，指使进士林东，上书吹捧死去的秦桧。赵构大怒，斥责林东狂妄，流放英州管制。林一飞也因怂恿之罪，贬职高州做盐税监。
二月底，左朝散大夫王曮为秦桧亲党，移送建昌军居住，直徽猷阁吕愿中贪婪暴虐、依附秦桧，贬为果州团练副使，安置在封州。
五月，赵构正式任命沈该、万俟卨为左右宰相。汤思退为知枢密院事，将宰相职务和枢密院使分开，宰相兼任枢密院使的时代过了。
十月初一，赵构再下诏，准许秦桧在位时，无辜活罪者上疏自陈，以便朝廷改正。十月底，宋贶党附秦桧，安置在梅州。至此秦桧余毒，基本清除。
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