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经历过重重冒险后，故事线再次拉到圣蒂学院，转眼沈程已经大三，而长孙棠迟迟未回学院，与沈程两年未见。
圣蒂学院会出现一场大的危机，根源于灵武山脉有着一只镇山灵兽（初步设定是一只隐藏在地底的7阶草系灵兽，不是奉神）
7阶灵兽没有攻击力，以身体滋养着灵武山脉，庇佑一方水土，乃是圣蒂学院以及东临各处秘境的依存之本。
这也解释了圣蒂学院即使不是贵族学院，也能成为天龙帝国的超级学院之一。
此次圣蒂学院危机是焚焰宗造成的（切入点是谢天烈，以及一名老师，老师也是焚焰宗潜伏的人，这也解释了之前长孙棠为何迟迟不对谢天烈动手，因为学院一直有高手保护他，但她无论如何也没想到潜伏的居然是自己老师），
但实际上焚焰宗内部早已被噬灵门渗透，所以圣蒂学院此次7阶灵兽的危机背后有一名噬灵门大能作祟，初步设定是地门第3，乃一名宗师级御兽师，等级85级！
此时实力深不可测的老头院长已经去了帝都（天龙帝国与威远帝国战争白热化，政府召集各个校长选拔皇家御兽军事宜，为后面沈程加入皇家御兽军做铺垫）
没办法，凌风率领圣蒂学院众师生与地门死战。
地门的手段远比玄门高得多，各种逆天噬灵术层出不穷！
但凌风作为曾经的天才，圣翼仙鹤爆发大能，极限将噬灵门换走，凌风最强灵兽圣翼仙鹤牺牲，而地门第3由此陨落。
而沈程作为学生第一人，爆发力量干掉了潜伏在圣蒂学院的那个焚焰宗老师，后来帝国皇家御兽军赶到，阻止了噬灵门的阴谋，圣蒂学院的焚焰宗被清算。
此时，沈程与皇家御兽军的一个女主（实则为天龙帝国公主）结识。
至此，圣蒂学院危机解除，全国大赛开始！
与以往的全国大赛不同，本次政府举办全国大赛还有一个目的，那就是在优秀学子中募集皇家御兽师参与战争！
沈程来到帝都，参加全国大赛，同时与在培育师学院深造的楚芷再遇，楚芷已然有一堆追求者，不得已为了老婆，沈程再次在培育师学院开启装逼打脸路，力压培育师学院众多娇子，将楚芷接走。
全国大赛上，沈程无比耀眼，5只灵兽＋小紫，6V6战斗披荆斩棘，荣获全国大赛冠军！
此时，莱茵帝国趁着天龙帝国与威远帝国打仗的空隙，已经将机械之城完全吞并，天龙帝国东北领土即将陷入战乱！
机械之城的康若欣带着家族逃难，带着所有家产来帝国投奔自己的未婚夫沈程，
沈程此刻才意识到覆巢之下无完卵，楚芷学成归来，也加入了皇家御兽军的后备军团。
一向对战争不感冒并拒绝参军多次的沈程，在这种国破家亡的责任感下，毅然决定加入皇家御兽军！
皇家御兽军的元帅亲自来迎接沈程，但是沈程告诉他自己还有没办完的事情，那就是要去南衍宗履行长孙棠的承诺。
沈程一人独赴南衍宗，长孙棠与主角的感情线正式开始。
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