华严宝殿供奉华严三圣，正中为毗卢遮那佛，释迦牟尼佛的法身，两侧是文殊菩萨和普贤菩萨。其中手持如意，身骑青狮的是以智慧闻名的文殊菩萨。手持莲花，身骑白象的是以大行闻名的普贤菩萨。
陈发对王心怡解释道：“普贤菩萨拜事业，中间毗卢遮那佛求健康，又边文殊求智慧。”
在《华严经》中，文殊菩萨是毗卢遮那佛最重要的两位助手之一，长期陪伴在佛陀的左侧，象征着佛法的智德和证德，代表着大乘佛法走入人群之中的诸多方便善巧、应世化俗和移风易俗的生机勃勃、以及佛法中不共世间的无上甚深智慧和金刚锋利般的般若正见。普贤菩萨，则是作为毗卢遮那佛的另一位最重要的助手，长期陪伴在佛陀的右侧，象征着佛法的理德和行德，代表着大乘佛法严密系统的理论、顺序次第的禅定和丰富具体的实践。
修学文殊菩萨的智慧，遵循普贤菩萨的行愿，其实就是把大乘佛法的无上般若智慧和具体修行实践，紧密地结合在一起，从而把大乘佛法菩萨道中，所有的“境、行、果”，都迅速地修学契入和圆满完成。
王心怡跪在每个佛像前一一叩拜。紧接着他们又来到大愿宝殿，位于三大宝殿靠西。
大愿宝殿与华严宝殿风格类似，殿堂前有八根青石龙柱，为深雕浮刻，每柱有两条龙对迎而翔，盘绕升腾，中间刻有宝珠为伴，龙柱两两相对，各具其形，造型优美生动，龙姿栩栩如生。
顾名思义，大愿宝殿供奉大愿地藏王菩萨，四面金身地藏比丘，身披袈裟福田衣、左手托一颗宝珠、右手握一支锡杖。
王心怡抬眼望去，只见眼前这尊地藏王菩萨法相格外庄严肃穆，令人心生敬畏。此时，身后恰好有旅游团在导游的带领下路过。导游声音洪亮地向游客们介绍道：“各位游客，眼前这尊地藏王菩萨极为殊胜，大家若虔诚礼拜，消业障之效甚佳，请务必认真参拜。”导游话语刚落，游客们便纷纷响应，不约而同地朝着菩萨像前的蒲团走去。一时间，跪拜之人众多，前排的蒲团竟显得供不应求。于是，在蒲团后方很快排起了长长的队伍，众人皆耐心等待着上前礼拜的机会。更有甚者，因实在等不及，便直接双膝跪地，在光洁的地板上诚心磕头，对地藏王菩萨表达着自己的敬意与祈愿。
王心怡和陈发离开了大愿宝殿，前往大悲宝殿，位于三大宝殿靠东。
大悲宝殿是三大宝殿中建成最早，原名大悲楼，很多当地人还是习惯称旃檀林为“大悲楼”。大悲宝殿全木窗门，古朴典雅，殿前两根盘龙石柱，台阶正中是由青石制作的九龙浮雕图，惟妙惟肖。
顾名思义，大悲宝殿供奉大悲观世音菩萨，正中为四面千手观音像。大悲宝殿两侧供奉84尊观音变身像，在汉传佛教寺院极为少见。
这时又有导游带领众多游客参拜千手观音。导游解释道：“按照大乘佛教的说法，观世音菩萨为了解救众生的痛苦，可以变现各类化身，不同的大乘佛教经典说法不一，《法华经》称有33种，谓三十三身观音，《楞严经》称有32种，谓三十二应身观音。旃檀林大悲宝殿供奉的84尊观音像是根据《大悲咒》的84句咒语而塑造，一句咒语是一位应身菩萨的形象。实际当前流行的《大悲咒》中，“娑啰娑啰”这一句代表的是五浊恶世，其余只有83句代表名号。”经导游这般解释，程发与王心怡犹如拨云见日，心中豁然开朗，对观音菩萨的敬意与尊崇更添几分，对这寺庙所蕴含的深厚宗教文化内涵也有了更深层次的领悟。
他们又来到玉佛殿，里面供奉一尊卧佛。卧佛一手支头，一手搁身，刻工精湛，神态逼真，将卧佛苦思冥想的神态表露无遗。
紧接着他们又去了明净肉身殿，位于大愿宝殿后。
明净和尚，俗名徐方柱，1928年生，安徽郎溪人。幼年丧母，家境贫寒，受祖辈信佛影响，从小不食荤腥，吃素念佛，心怀慈悲。由于慧根深厚，从事繁重农活，从未间断自身修行，打坐入静，极为虔诚。1984年决心出家，上九华山苦修，于天台寺出家，后常驻旃檀林，做香灯师。明净修持奇特，曾站禅、坐禅3年，闭关3年，闭关时有时十余日用一餐，不论寒暑长年赤足，人们称其“疯和尚”。1992年9月在旃檀林安然圆寂，弟子遵其生前保留真身的嘱咐，将其坐缸存放。1998年12月开缸，肉身完好，颜面如生，遂装金供奉。
他们在拜完明净和尚的肉身之后，便打算从寺院侧门离去。行至途中，一座高大的石雕观音菩萨圣像映入眼帘，其仪容慈悲祥和，透着无尽庄严。王心怡见状，当即虔诚地跪地，向观音菩萨恭敬地磕了三个头。而在这尊观音菩萨石像的正对面，恰好矗立着一尊石雕地藏王菩萨。王心怡旋即又转向地藏王菩萨，以头触地，磕了一个响头。这一路的九华山之行，让他深切地感受到地藏王菩萨与观音菩萨之间似有千丝万缕的深厚渊源，仿佛有地藏王菩萨之处，观音菩萨定会相伴，而观音菩萨现身之所，地藏王菩萨亦如影随形。
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