概念崩解危机平息后，宇宙的因果律突然出现剧烈震荡。阿雷克斯的机械联邦监测到，部分星球的历史记录开始逆向播放，未来科技产物提前出现在远古遗迹中；莱娅的灵羽族圣地，先知们的预言能力彻底颠倒，只能看到已经发生的事，却无法预见未来。更诡异的是，全宇宙生命体的记忆出现混乱，有人记得从未发生过的胜利，也有人深陷虚构灾难的恐惧。
苏尘与洛瑶的力量被因果乱流彻底搅乱。苏尘每次施展混沌之力，都会意外触发未来某个时间点的自己穿越回来，这些来自未来的“他”伤痕累累，却拒绝透露任何信息；洛瑶的星光之力则不断回溯过去，治愈早已愈合的伤口，却让当下的创伤愈发严重。两人的意识被卷入一条逆流的因果长河，河中漂浮着无数破碎的命运残片，他们看到自己在不同时间线里既是救世主，又是毁灭者。
银河守望者联盟的舰队在执行任务时陷入因果悖论。战舰刚出发就收到自己被摧毁的求救信号，攻击敌人的炮弹却在发射前击中己方母舰。薇尔莉特带领的特遣队试图用“因果锚定器”稳定时空坐标，却发现装置反而加剧了因果紊乱。队员们的身体开始出现时间错位：左手是少年模样，右手却已苍老腐朽，有人甚至开始逐渐消失，只因在某个被篡改的时间线里，他们早已死亡。
莱娅发动灵羽族失传的“溯因追果”仪式，以燃烧千年寿元为代价，揭开这场危机的真相。在宇宙诞生之初，十二工匠创造了“因果织机”，用于编织稳定的时间线。但随着宇宙多次经历危机，织机核心的“逆命者”挣脱束缚。逆命者是所有文明对命运不甘的怨念集合体，它妄图通过倒悬因果，让全宇宙陷入“结果先于原因”的永恒混乱，以此证明命运的不可捉摸。
阿雷克斯带领科研团队启动“因果修复协议”，在各个星域建造巨型“时间矫正塔”。他们试图用量子纠缠技术重新锚定因果节点，用灵羽族的时空咒文修复紊乱的时间线。然而，逆命者不断制造新的因果悖论，矫正塔的能量输出反而成为扭曲时间的帮凶，咒文也被转化为引发混乱的指令。普通星球上，四季颠倒，生死轮回错乱，新生婴儿带着老人的记忆降临。
苏尘与洛瑶在因果长河的尽头，找到了逆命者的本体——一团由无数破碎的时钟齿轮组成的漩涡，每个齿轮都刻着某个文明被篡改的命运。“你们以为因果就该一成不变？”逆命者的声音混杂着时钟的滴答与玻璃破碎的声响，“当结果成为原因，一切秩序都将失去意义！”两人在混乱中艰难前行，不断遭遇被因果扭曲的敌人：来自未来的邪恶自己、被改写历史的昔日战友。
关键时刻，全宇宙文明将对“命运可控”的信念与对“真实因果”的渴望注入苏尘与洛瑶体内。他们将混沌之力、星光之力与文明意志融合，形成能斩断错误因果的“命运重织梭”。当梭子划过因果长河，倒悬的时间线开始归位，破碎的命运残片重新拼凑。逆命者在光芒中发出不甘的怒吼，最终消散成点点星光。
战后，创生之树生长出“因果稳固根系”，自动监测并修复时间线的异常。苏尘与洛瑶的力量化作守护因果律的屏障，每当因果危机出现，他们的光芒就会照亮混乱的时空。但在宇宙的某个未知角落，逆命者的残念仍在聚集，等待着用更复杂的因果陷阱，再次将文明推向毁灭的边缘……
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