苻坚那基于现代模糊记忆和绝境求生意志下达的防疫令，如同投入沸腾油锅的一滴冷水，并未能立刻平息灾难，反而在最初激起了更大的恐慌和混乱。
焚烧尸体？在笃信入土为安、死者为大的时代，这无异于亵渎亡灵，激起了幸存者们本能的、歇斯底里的反抗。隔离病患？意味着抛弃亲人，任其自生自灭，触碰了人性最后的底线。集中管控？在秩序已然崩坏的长安，更像是暴政和屠杀的前奏。
影狼和他手下仅存的十一名“绣衣”，如同游走在炼狱边缘的灰色幽魂，冷酷地执行着皇帝的命令。他们的人数太少，面对的是数万陷入疯狂和绝望的军民。冲突不可避免地爆发了。试图阻止焚烧亲人尸体的百姓被毫不留情地格杀；藏匿病患的家庭被整个封锁，任其在内自灭；争夺干净食物和水的械斗，往往以一方甚至双方全部被“绣衣”处决告终。
血，流得更多了。长安的街道上，除了瘟疫造成的死亡，又增添了无数因抗令而被杀的尸体，进一步加剧了恐怖的氛围。“绣衣”们成了比瘟疫更令人恐惧的勾魂使者，他们的身影所到之处，带来的不是秩序，而是更深沉的绝望和无声的诅咒。
未央宫内，情况稍好，但也仅仅是稍好。隔离政策被强行推行下去，清凉殿一带聚集了宫中最后一批尚未发病的人，包括那个被影狼找到的、奄奄一息的婴儿，由几个同样幸运还未染病的年老宫嬷勉强照料着。水源被严格控制，食物统一配给烹煮。但恐慌依旧如同跗骨之蛆，折磨着每一个人。每一次有人被拖走隔离，都会引发一阵压抑的哭泣和骚动。
苻坚自己也出现了轻微的不适，腹泻了几次，低烧反复。他强撑着，拒绝被隔离，依旧坐在宣室殿内，依靠着顽强的意志和或许穿越带来的些许不同，硬生生扛了过去。但他的身体变得更加虚弱，每一次呼吸都带着胸腔深处的灼痛。
窦冲没能撑过去。这位忠诚悍勇的将军，在断臂重伤和高烧呕吐的双重折磨下，于一个夜晚悄无声息地死在了他坚守的岗位附近。至死，他手中还紧握着他那柄卷刃的横刀。苻坚得知消息后，沉默了许久，最终只是挥了挥手，让人将其尸体同样火化，甚至没有多余的力气悲伤。
毛当时昏时醒，靠着一点米汤吊着命，已然灯枯油尽。
死亡，成了长安城唯一的主旋律。白日，黑色的烟柱从多处焚尸点升起，带着皮肉烧焦的恶臭，笼罩全城。夜晚，哀嚎声和哭泣声稀疏了不少，不是因为好转，而是因为能发出声音的人越来越少了。整座城市以肉眼可见的速度“安静”下去，一种死寂的、令人毛骨悚然的安静。
然而，就在这极致的绝望中，一丝极其微弱的、谁也不敢期待的转机，却悄然萌芽。
焚烧尸体，尽管过程残酷，确实在一定程度上减少了病毒扩散的源头。隔离病患，虽然无情，也勉强延缓了瘟疫在未感染人群中的蔓延速度。喝煮沸的水，吃彻底煮熟的食物，这最朴素的做法，竟然真的让一小部分人，包括苻坚和清凉殿的那批人，奇迹般地挺了过来。
瘟疫的魔威，在达到顶峰之后，似乎…开始呈现出缓慢消退的迹象。新发病例的增长速度明显放缓了，虽然每天依旧有人死去，但不再像之前那样成片成片地倒下。
而城外，也发生了翻天覆地的变化。
慕容冲的西燕军，同样被这突如其来的瘟疫吓破了胆。
吕光军溃退时那“瘟疫！”的凄厉嚎叫，他们也听得清清楚楚。紧接着，他们就目睹了长安城内升起一道道焚尸的黑烟，嗅到了那随风飘来的、令人作呕的焦臭和恶息。他们不知道城内具体发生了什么，但“瘟疫”两个字，足以让任何古代军队闻风丧胆。
慕容冲试图严密封锁消息，稳定军心，但恐惧传播得比瘟疫更快。很快，西燕军营中也开始出现类似的呕吐腹泻症状——或许是之前交战接触所致，或许只是心理作用下的群体性癔症。无论原因如何，恐慌如同野火般在围城大军中蔓延开来。
围攻长安数月，西燕军本就师老兵疲，士气低落，全靠破城在即的诱惑和慕容冲的严酷军令维系。此刻加上对无形瘟魔的恐惧，士气彻底崩溃。逃兵开始出现，而且越来越多，军官弹压不住，甚至不少军官自己也心生去意。
慕容冲俊美的脸庞因愤怒和恐惧而扭曲，他斩杀了几名带头动摇的将领，却无法阻止整个军心的涣散。继续围困一座爆发了瘟疫的死城？没有任何意义，反而可能将自己的大军全部葬送在这里！
最终，在围城将近五个月后，在一个天色阴沉、细雨蒙蒙的清晨，西燕军营地响起了撤退的号角。
没有欢呼，没有留恋，只有一片死寂般的匆忙和压抑到极点的恐惧。士兵们默默地、甚至争先恐后地拔营起寨，丢弃了大量不便携带的物资，如同躲避洪荒猛兽般，向着东方快速退去。连慕容冲那华丽的麾盖，在细雨中也都显得仓皇落寞。
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