朝廷起用刘基为江浙省元帅府都事，主要任务是帮助当地政府平定浙东一带的盗贼，特别以方国珍为对象。元左丞帖里帖木儿欲招安方国珍。
刘基认为方氏兄弟为首犯，对本地的影响太坏，不诛无以惩戒后人。
方国珍知道了这件事情之后，马上以重赂官府，终被招安，并授以官职，得了明正言顺的地位之后，他马上反过来谴责刘基擅威福。
刘基一怒之下辞官还里，以表对元朝腐败昏聩之不满。
刘基破了土龙之后，朱元璋夜里梦见相星相辅，特别高兴，马上找来人帮其观看天星，命师对朱元璋道，吴公，所助你之士，应该是刘基呀！
朱元璋大喜，至正二十年，（1360），被朱元璋请至应天，委任他为朱元璋的谋臣，刘基看到自己遇到了知己，也知朱元璋乃是真龙天子，心里特别高兴。
经过自己的多方考察，再针对当时的形势，他向朱元璋提出了避免两线作战，应采用各个击破的建策，朱元璋经过细仔的分析，最后采纳了他的见建策。
根据他的战略方针，辅佐朱元璋集中兵力，先后灭掉了陈友谅，后来，张士诚等人的势力也被他们消灭，让他的战略获得了巨大成功。
看到朱元璋的优势越来越大，刘基马上建议他脱离“小明王”韩林儿自立一方，同时又用“大明”为国号，来招揽天下义师收民心。
当时，陈友谅攻陷太平，意欲东向，气势特别的嚣张，在陈友谅看来，他以拥有很大的地盘，纵观天下，唯自己独大，不把任何势力放在眼里。
看到形势对自己一方越来越不利，朱元璋手下的大将，有的劝他投陷，有的认为必须避其锋芒，再据守南京等日后寻机再战。
众将争论不休，搞的主帅朱元璋意犹未决，不知道应该听从那一方更好，而这个时候，刘基坐在那里，并不表态，只是沉默不言。
(本章完)
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