老鼠的中毒死亡给吴秋水带来了启发，她认为神经中毒后的症状跟渐冻症有着很大的相似，她就从神经毒素方面开始研究肌萎缩侧索硬化病。
接下来，吴秋水开始用毒蛇的神经毒素给小白鼠注射进行试验，她发现小白鼠的中毒症状跟神经毒素的剂量有关，而且这种神经毒素的伤害也是不可逆的。其实毒蛇的毒液主要成分就是血液毒素和神经毒素，血液毒素主要影响血液系统，它能导致血液凝固、溶血或者破坏血液循环。神经毒素主要作用于神经系统，干扰神经传导，导致神经功能障碍。
吴秋水就从毒蛇的神经毒素对小白鼠的运动神经元伤害为研究对象，然后找出相应的作用机理，最后分析小白鼠运动神经元的衰竭情况。神经毒素是一组碱性多肽蛋白，这种神经毒素能够通过特异性的突触酶来结合运动神经元细胞的活性受体，从而使运动神经元细胞受损，阻断了神经信号的传递。随之而来出现了肌肉麻痹和呼吸衰竭。
渐冻症的运动神经元损坏与神经毒素造成的运动神经元损坏几乎相同，吴秋水分析后认为，渐冻症的成因很可能跟基因中毒有关。她在反复实验中发现，神经毒素会让运动神经元细胞中毒，从而造成运动神经元细胞损坏。而渐冻症似乎就是一种不明的病毒侵入了运动神经元细胞，于是就有了运动神经元病变。
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