他的继任者穆罕默德二世（Mehmed II）“征服者”于1453年攻陷了拜占庭首都君士坦丁堡（Constantinople）。
最后一位皇帝的兄弟德梅特里奥斯·帕莱奥洛戈斯（Demetrios Palaiologos）和托马斯·帕莱奥洛戈斯（Thomas Palaiologos）未能向他提供任何援助，因为摩雷亚刚经历了一次奥斯曼的攻击。
他们的无能导致了1453至1454年摩雷亚叛乱的爆发，曼努埃尔·康塔库泽诺斯（Manuel Kantakouzenos）在叛乱中反对他们，并邀请奥斯曼军队来帮助平息叛乱。
在此期间，希腊贵族与穆罕默德达成了和平协议。
经过多年的无能统治，专制统治者未能按时向苏丹支付年贡，最终他们自己对奥斯曼统治的反叛，穆罕默德于1460年5月进入摩雷亚。
德梅特里奥斯最终成为奥斯曼的囚徒，而他的弟弟托马斯逃跑。
到夏季结束时，奥斯曼几乎已使所有希腊城市屈服。
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1423年后，土耳其人对摩雷亚的入侵在图拉汉·贝伊（Turahan Bey）统治下重新开始。
尽管在科林斯地峡重建了赫克萨米利翁城墙，但穆拉德二世于1446年攻破了这道防线，迫使摩雷亚的专制统治者重新承认奥斯曼的宗主权，并在1452年和1456年再次被图拉汉击败。
1456年奥斯曼占领雅典公国（Duchy of Athens）后，1458年占领了伯罗奔尼撒半岛三分之一的地区，苏丹穆罕默德二世于1460年消灭了摩雷亚专制的残余势力。
少数抵抗者仍然存在了一段时间。
莫尼瓦西亚（Monemvasia）的崎岖半岛拒绝投降，最初由一位加泰罗尼亚海盗短暂统治。当居民将他赶走后，他们获得了托马斯的同意，在1460年底之前向教皇申请保护。
摩雷亚南端的马尼半岛（Mani Peninsula）在当地部落的松散联盟下抵抗，该地区后来归威尼斯统治。
最后的抵抗者是位于摩雷亚西北的萨尔梅尼科（Salmeniko），该地的军事指挥官是格拉伊察斯·帕莱奥洛戈斯（Graitzas Palaiologos），他驻扎在萨尔梅尼科城堡。
虽然城镇最终投降，但格拉伊察斯和他的驻军以及一些居民在城堡中坚守到1461年7月，最终逃离并到达了威尼斯领土。
只有威尼斯的莫东（Modon）、科隆（Coron）、纳瓦里诺（Navarino）、莫尼瓦西亚、阿尔戈斯（Argos）和纳夫普利翁（Nauplion）堡垒逃脱了奥斯曼的控制。
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这一时期还伴随着基督教阿尔巴尼亚人迁移和定居到希腊中部和伯罗奔尼撒半岛的部分地区，他们最终被称为阿尔瓦尼特人（Arvanites）。
阿尔巴尼亚人以连续的波浪形式定居，常常是受到当地统治者的邀请。
从14世纪后半期开始，他们频繁出现在历史记录中，那时他们被提供可耕地、牧场和优惠的税收，以换取军事服务。
一个较大的阿尔巴尼亚移民团体在西奥多一世（Theodore I Palaiologos）统治期间迁入伯罗奔尼撒，人数达到10,000人，最初在阿卡迪亚（Arcadia），随后扩展到梅塞尼亚（Messenia）、阿戈利斯（Argolis）、伊利斯（Elis）和阿卡亚（Achaia）等地区。
约在1418年，第二个大规模移民团体抵达，可能是逃离阿艾托利亚（Aetolia）、阿卡尔南尼亚（Acarnania）和阿尔塔（Arta），因为这些地方的阿尔巴尼亚政治势力遭到击败。
这些定居的阿尔巴尼亚人以部落的形式生活，分散在小村庄中，以游牧为主的牧业和畜牧业为生。
到15世纪中期，他们已形成了伯罗奔尼撒半岛相当一部分的人口。
时代的军事资料（1425年）报告称，伯罗奔尼撒有约30,000名阿尔巴尼亚男子能够携带武器。
希腊人倾向于生活在大村庄和城市，而阿尔巴尼亚人则居住在小村庄中。
在奥斯曼征服后，许多阿尔巴尼亚人逃往意大利，主要定居在今天的卡拉布里亚（Calabria）和西西里（Sicily）的阿尔贝雷舍村（Arbereshe villages）。
另一方面，为了控制剩余的阿尔巴尼亚人，奥斯曼人在15世纪后半期实施了对他们有利的税收政策，这可能是延续了拜占庭的类似做法。
然而，这一政策到16世纪初便停止了。
在奥斯曼-威尼斯战争期间，许多阿尔巴尼亚人在为威尼斯服务时死去或被俘。
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